Když je raketa na správné cestě, Trident naviguje za pomocí inerciálního naváděcího systému, který je založen na velkém množství citlivých akcelerometrů, které přesně zaznamenávají zrychlení a dobu letu. Palubní počítač následně použije tato data k výpočtu rychlosti a pozice rakety. Je obvyklé, že tyto systémy bývají v armádách nahrazovány systémem GPS, protože inerciální systémy bývají po nějaké době nepřesné, ale v tomto případě to nevadí, protože let trvá pouhých několik minut. Trident ještě nikdy nebyl vypálen se systémem GPS kvůli obavě ze zranitelnosti systému.
Kvůli limitům, které mají vnitřní naváděcí systémy, je Trident vybavený i navigačním systémem, který využívá na orientaci hvězdy. Stejně jako námořník za „starých časů“, senzory zachytí přesné postavení hvězd za účelem jemné korekce letu. Tato korekce je nutná kvůli tomu, že přesné umístění ponorky nemusí být v době odpalu známo. „Kompas“ rakety také někdy mohou rozhodit různé gravitační anomálie, takže je nutné, aby se raketa ve hvězdách vyznala.
Výbušné finále
Když se střela přiblíží k cíli, rozdělí se na dvanáct nezávislých hlavic o ráži 100 kilotun (6x tolik co bomba v Hirošimě). Odchylka při dopadu by měla být menší než 120 metrů, což by při takové výbušné síle mělo stačit na likvidaci cíle.